| 车次 | 始发站 | 始发时间 | 出发站 | 开车时间 | 到达站 | 到达时间 | 终点站 | 终到时间 |
| Z51 | 北京 | 18:57 | 如皋 | 07:42 | 南通 | 08:07 | 南通 | 08:07 |
| K135 | 昆明 | 18:55 | 如皋 | 10:10 | 南通 | 11:12 | 南通 | 11:12 |
| K138 | 昆明 | 18:55 | 如皋 | 10:10 | 南通 | 11:12 | 南通 | 11:12 |
| D5411 | 南京 | 08:07 | 如皋 | 10:22 | 南通 | 10:48 | 启东 | 11:42 |
| D5414 | 南京 | 08:07 | 如皋 | 10:22 | 南通 | 10:48 | 启东 | 11:42 |
| D5432 | 南京 | 08:07 | 如皋 | 10:22 | 南通 | 10:48 | 启东 | 11:38 |
| D5433 | 南京 | 08:07 | 如皋 | 10:22 | 南通 | 10:48 | 启东 | 11:38 |
| D5554 | 南京 | 09:50 | 如皋 | 12:10 | 南通 | 12:35 | 南通 | 12:35 |
| D5555 | 南京 | 09:50 | 如皋 | 12:10 | 南通 | 12:35 | 南通 | 12:35 |
| D9492 | 南京 | 10:00 | 如皋 | 12:19 | 南通 | 12:45 | 南通 | 12:45 |
| D9493 | 南京 | 10:00 | 如皋 | 12:19 | 南通 | 12:45 | 南通 | 12:45 |
| D5436 | 南京 | 12:53 | 如皋 | 15:00 | 南通 | 15:26 | 启东 | 16:16 |
| D5437 | 南京 | 12:53 | 如皋 | 15:00 | 南通 | 15:26 | 启东 | 16:16 |
| D3158 | 汉口 | 10:29 | 如皋 | 15:19 | 南通 | 15:46 | 南通 | 15:46 |
| D3155 | 汉口 | 10:29 | 如皋 | 15:19 | 南通 | 15:46 | 南通 | 15:46 |
| D5442 | 南京 | 13:56 | 如皋 | 16:12 | 南通 | 16:37 | 启东 | 17:31 |
| D5443 | 南京 | 13:56 | 如皋 | 16:12 | 南通 | 16:37 | 启东 | 17:31 |
| D5532 | 南京 | 14:47 | 如皋 | 17:08 | 南通 | 17:33 | 南通 | 17:33 |
| D5533 | 南京 | 14:47 | 如皋 | 17:08 | 南通 | 17:33 | 南通 | 17:33 |
| D9546 | 南京 | 15:52 | 如皋 | 18:11 | 南通 | 18:38 | 南通 | 18:38 |
| D9547 | 南京 | 15:52 | 如皋 | 18:11 | 南通 | 18:38 | 南通 | 18:38 |
| K8599 | 徐州 | 11:10 | 如皋 | 18:26 | 南通 | 18:55 | 南通 | 18:55 |
| D5446 | 南京 | 18:13 | 如皋 | 20:26 | 南通 | 20:52 | 启东 | 21:50 |
| D5447 | 南京 | 18:13 | 如皋 | 20:26 | 南通 | 20:52 | 启东 | 21:50 |
| K92 | 深圳东 | 18:02 | 如皋 | 21:45 | 南通 | 22:16 | 南通 | 22:16 |
| K93 | 深圳东 | 18:02 | 如皋 | 21:45 | 南通 | 22:16 | 南通 | 22:16 |