| 车次 | 始发站 | 始发时间 | 出发站 | 开车时间 | 到达站 | 到达时间 | 终点站 | 终到时间 |
| D5504 | 南通 | 06:10 | 南通 | 06:10 | 江都 | 07:35 | 南京 | 08:47 |
| D5514 | 南通 | 10:02 | 南通 | 10:02 | 江都 | 11:33 | 南京 | 12:45 |
| K91 | 南通 | 11:40 | 南通 | 11:40 | 江都 | 13:40 | 深圳东 | 14:28 |
| K94 | 南通 | 11:40 | 南通 | 11:40 | 江都 | 13:40 | 深圳东 | 14:28 |
| D9494 | 南通 | 14:03 | 南通 | 14:03 | 江都 | 15:39 | 南京 | 16:55 |
| D5556 | 南通 | 16:14 | 南通 | 16:14 | 江都 | 17:41 | 南京 | 18:53 |
| D5448 | 启东 | 16:39 | 南通 | 17:29 | 江都 | 18:56 | 南京 | 20:10 |
| D9548 | 南通 | 19:25 | 南通 | 19:25 | 江都 | 20:50 | 南京 | 22:00 |