| 车次 | 始发站 | 始发时间 | 出发站 | 开车时间 | 到达站 | 到达时间 | 终点站 | 终到时间 |
| D5432 | 南京 | 08:07 | 南通 | 10:51 | 启东 | 11:38 | 启东 | 11:38 |
| D5433 | 南京 | 08:07 | 南通 | 10:51 | 启东 | 11:38 | 启东 | 11:38 |
| D5414 | 南京 | 08:07 | 南通 | 10:54 | 启东 | 11:42 | 启东 | 11:42 |
| D5411 | 南京 | 08:07 | 南通 | 10:54 | 启东 | 11:42 | 启东 | 11:42 |
| D5418 | 南京 | 12:53 | 南通 | 15:23 | 启东 | 16:08 | 启东 | 16:08 |
| D5436 | 南京 | 12:53 | 南通 | 15:28 | 启东 | 16:16 | 启东 | 16:16 |
| D5437 | 南京 | 12:53 | 南通 | 15:28 | 启东 | 16:16 | 启东 | 16:16 |
| D5442 | 南京 | 13:56 | 南通 | 16:40 | 启东 | 17:31 | 启东 | 17:31 |
| D5443 | 南京 | 13:56 | 南通 | 16:40 | 启东 | 17:31 | 启东 | 17:31 |
| D5422 | 南京 | 18:12 | 南通 | 21:00 | 启东 | 21:46 | 启东 | 21:46 |
| D5446 | 南京 | 18:13 | 南通 | 21:00 | 启东 | 21:50 | 启东 | 21:50 |
| D5447 | 南京 | 18:13 | 南通 | 21:00 | 启东 | 21:50 | 启东 | 21:50 |