| 车次 | 始发站 | 始发时间 | 出发站 | 开车时间 | 到达站 | 到达时间 | 终点站 | 终到时间 |
| D3211 | 湖州 | 06:35 | 杭州东 | 07:10 | 厦门北 | 13:04 | 厦门北 | 13:04 |
| D3238 | 南京南 | 06:14 | 杭州东 | 07:28 | 厦门北 | 16:47 | 厦门北 | 16:47 |
| D3239 | 南京南 | 06:14 | 杭州东 | 07:28 | 厦门北 | 16:47 | 厦门北 | 16:47 |
| D3111 | 杭州东 | 07:33 | 杭州东 | 07:33 | 厦门北 | 14:21 | 深圳北 | 18:15 |
| D3145 | 上海虹桥 | 06:40 | 杭州东 | 07:43 | 厦门北 | 14:45 | 赣州 | 18:04 |
| D3148 | 上海虹桥 | 06:40 | 杭州东 | 07:43 | 厦门北 | 14:45 | 赣州 | 18:04 |
| D2287 | 上海虹桥 | 07:02 | 杭州东 | 08:13 | 厦门北 | 14:50 | 深圳北 | 18:25 |
| D3307 | 杭州东 | 08:19 | 杭州东 | 08:19 | 厦门北 | 15:14 | 深圳北 | 18:47 |
| D3131 | 上海虹桥 | 07:37 | 杭州东 | 08:42 | 厦门北 | 15:24 | 龙岩 | 16:33 |
| D3134 | 上海虹桥 | 07:37 | 杭州东 | 08:42 | 厦门北 | 15:24 | 龙岩 | 16:33 |
| D377 | 上海虹桥 | 07:46 | 杭州东 | 09:09 | 厦门北 | 15:40 | 深圳北 | 19:25 |
| D3201 | 上海虹桥 | 08:20 | 杭州东 | 09:31 | 厦门北 | 16:34 | 厦门北 | 16:34 |
| D3295 | 南京南 | 07:45 | 杭州东 | 09:39 | 厦门北 | 16:39 | 龙岩 | 17:50 |
| D3298 | 南京南 | 07:45 | 杭州东 | 09:39 | 厦门北 | 16:39 | 龙岩 | 17:50 |
| D3125 | 南京 | 06:37 | 杭州东 | 10:14 | 厦门北 | 16:53 | 深圳北 | 20:34 |
| D2285 | 上海虹桥 | 09:05 | 杭州东 | 10:20 | 厦门北 | 16:59 | 深圳北 | 20:38 |
| D3205 | 上海虹桥 | 09:35 | 杭州东 | 10:41 | 厦门北 | 17:21 | 厦门北 | 17:21 |
| D3107 | 上海虹桥 | 09:40 | 杭州东 | 11:25 | 厦门北 | 17:52 | 深圳北 | 21:33 |
| D2281 | 南京 | 07:46 | 杭州东 | 11:35 | 厦门北 | 18:05 | 深圳北 | 21:53 |
| D3165 | 杭州东 | 12:09 | 杭州东 | 12:09 | 厦门北 | 18:52 | 龙岩 | 20:31 |
| D3168 | 杭州东 | 12:09 | 杭州东 | 12:09 | 厦门北 | 18:52 | 龙岩 | 20:31 |
| D3135 | 南京 | 08:09 | 杭州东 | 12:15 | 厦门北 | 19:09 | 赣州 | 22:40 |
| D3138 | 南京 | 08:09 | 杭州东 | 12:15 | 厦门北 | 19:09 | 赣州 | 22:40 |
| D2283 | 上海虹桥 | 11:24 | 杭州东 | 12:29 | 厦门北 | 19:04 | 深圳北 | 22:40 |
| D2293 | 南京南 | 10:38 | 杭州东 | 12:50 | 厦门北 | 19:17 | 深圳北 | 23:01 |
| D3291 | 上海虹桥 | 12:15 | 杭州东 | 13:18 | 厦门北 | 20:13 | 龙岩 | 21:29 |
| D3294 | 上海虹桥 | 12:15 | 杭州东 | 13:18 | 厦门北 | 20:13 | 龙岩 | 21:29 |
| D3141 | 南京 | 11:12 | 杭州东 | 14:23 | 厦门北 | 20:59 | 龙岩 | 22:01 |
| D3233 | 杭州东 | 14:27 | 杭州东 | 14:27 | 厦门 | 22:10 | 厦门 | 22:10 |
| D3217 | 杭州东 | 15:54 | 杭州东 | 15:54 | 厦门北 | 22:41 | 厦门北 | 22:41 |